​​​​​​​اگرچه‌ کسی‎‌‎که او را عالیجناب خاکستری لقب داد و پدرخوانده جریان اصلاح‎‌‎طلبی دانست، حالا خودش ردای معاندت بر تن کرده، اما نمی‎‌‎توان نقش سیدمحمد موسوی‌خوئینی‎‌‌‎ها را در سال‎‌‎های نخست پس از انقلاب فراموش کرد و او را یکی از مؤثرترین‎‌‎ها قلمداد نکرد.